le des de biologie médicale

Tu viens d’avoir ton concours et tu penses peut-être choisir biologie à Lyon ? Félicitations ! En choisissant Lyon, tu rejoins la crème de la Biologie Médicale française.

Lyon c’est la capitale des Gaules, Guignol, la meilleure cuisine, le meilleur club de foot et accessoirement 4 groupements hospitaliers formant les Hospices Civils de Lyon (HCL, notre CHU, 2ème CHU de France).

On retrouve donc 3 laboratoires principaux qui sont :

  • Grand Est : Edouard Herriot (HEH), biochimie d’urgence et immunologie et le Centre de Biologie et de Pathologie Est (GHE), biochimie, hématologie, PMA.
  • Centre de Biologie Nord (GHN) : biochimie, hématologie, parasito-mycologie, virologie et bactériologie (Institut des Agents Infectieux).
  • Centre de Biologie Sud (GHS) : biochimie, hématologie, immunologie, toxicologie.

Depuis novembre 2018, le CHU de Saint-Etienne est rattaché à Lyon lors des choix de postes. A partir de la rentrée 2022, 3 internes parmi les 14 internes ayant choisi Lyon iront donc à Saint-Etienne. Ce CHU possède toutes les spécialités : biochimie, hématologie, agents infectieux, immunologie, etc.

comment se déroule l’internat ?

phase socle (2 ans)

Les deux premiers semestres sont consacrés aux DES d’ hématologie et de biochimie.

En deuxième année d’internat, tous les internes font leur semestre de bactériologie-virologie lors de leur 3ème ou 4ème semestre et un semestre en immunologie ou parasitologie (possibilité de combiner les 2 dans le même semestre).

Il est également possible de faire un stage dit « libre » sous réserve que les postes d’immunologie et de parasitologie soient pourvus.

Phase d’approfondissement (1 an)

  • Réalisation de stages en lien avec l’option précoce de l’interne (Biologie Générale, Biochimie-Biologie Moléculaire, Pharmacologie-toxicologie, Agents Infectieux, Hématologie Immmunologie, PMA)
  • A partir de cette phase, possibilité de réaliser une FST, une année recherche, un inter-chu.

Phase de consolidation (1 an)

  • L’interne doit obligatoirement être thésé pour entrer en phase de consolidation ou phase de Docteur Junior
  • Affectation des internes sur l’inter-région selon une adéquation entre leurs vœux et les terrains de stage (Big matching)
  • Réalisation du mémoire de DES pendant cette année.

A noter également qu’il est obligatoire de réaliser à minima 1 semestre dans un encadrement hors-CHU (= stage périphérique ou privé) pour valider son internat.

Parmi les périphéries et stages hors-CHU :

  • Villefranche
  • Vienne
  • Bourgoin-Jallieu
  • Bourg-en-Bresse
  • St Luc St Joseph
  • Valence
  • 1 laboratoire privé/semestre actuellement.

Il est donc possible de faire tout son internat de biologie médicale à Lyon ! Toutes les options précoces sont disponibles à Lyon : biologie générale ou polyvalente, médecine moléculaire-génétique-pharmacologie, hématologie et immunologie, agents infectieux ou encore biologie de la reproduction.

les étapes du des

La phase socle (les quatre premiers semestres) est dédiée au DES de biologie médicale. Beaucoup de cours à l’hôpital (les formations universitaires), de présentations, d’exposés en perspective. La formation lyonnaise est de qualité et réputée. La première année, on passe le DES d’hématologie et de biochimie, la deuxième celui d’infectiologie (bactério et viro) et d’immunologie.

le des de biochimie

La formation de base est commune aux 4 sites (GHE, CHLS, GHN et Saint-Etienne) et balaye les items fondamentaux de la biochimie : qualité/accréditation, techniques de dosages, interférences analytiques, gestion de la biologie délocalisée, etc.

Ces cours ont lieu le mercredi après-midi sur les différents sites.
S’ajoutent à cela des ateliers « fil rouge » communs à chaque site, portant sur les différents thèmes des dossiers biologiques que l’on rencontre en biochimie (bilan martial, biologie de la grossesse, marqueurs cardiaques, bilan thyroïdien, bilan lipidique, etc.). Ces ateliers sont animés par les biologistes du labo et comportent généralement un bref rappel théorique puis une discussion autour de l’interprétation de dossiers clinico-biologiques.

Les secteurs de biochimie spécialisée (hormonologie, dyslipidémie, nutrition, métabolisme, génétique, etc.) sont concentrés sur les sites de l’Est et du Sud.
L’évaluation repose sur des présentations réalisées par les groupes d’internes de chaque site, encadré par un biologiste senior : cas clinique imposé/choisi, présentation du plateau technique et présentation d’un analyte. A la fin du semestre, une interprétation individuelle d’un dossier clinico-biologique fait office d’évaluation finale.

le des d’hématologie

Les cours sont communs aux internes Lyonnais des trois laboratoires (et certains aux internes de Saint-Etienne). Ils ont lieu en général un après-midi par semaine, le plus souvent le mardi et/ou le jeudi après-midi, en alternance sur les trois sites. Ils concernent l’immuno-hématologie, l’hématologie cellulaire, l’hémostase. Un stage de 10 jours à l’EFS est prévu au cours du semestre.

Parmi les laboratoires d’hématologie, les pôles d’excellence sont organisés selon la répartition des services cliniques. Ainsi, Lyon Sud est la référence en cytologie (Lyon Sud accueille toute l’hématologie Clinique des HCL) bien que le GHE se défende puisqu’il traite les échantillons en provenance des centres régionaux de lutte contre le cancer adulte et pédiatrique (CLB et IHOP). De plus, le GHE est la référence pour l’hémostase (il héberge le Centre de Référence de Traitement des Hémophiles). Le CBN est un plus petit laboratoire mais avec un recrutement de patients intéressants (présence d’un service de transplantation important avec des bilans d’hémostase).

L’évaluation d’hématologie repose sur la note de stage, les présentations faites par l’interne lors de son stage, une évaluation à la lecture de lame de sang et un audit final. L’évaluation est assez variable en fonction des différents sites.

Le DES d’immunologie

Depuis novembre 2021, les DES d’hématologie et d’immunologie sont séparés. Les cours d’immunologie sont dispensés en 2ème année durant le semestre d’immunologie, parasitologie ou semestre libre. Il sera nécessaire de poser une demi-journée de congés formation universitaire pour assister aux enseignements. L’évaluation d’immunologie repose sur une évaluation continue (QCM, présentations) et finale avec des cas cliniques progressifs en ligne.

Le DES de bactériologie-virologie

Tous les internes effectuent leur semestre de bactériologie/virologie au CBN où se trouve l’Institut des Agents Infectieux.

Le premier mois du semestre en bactériologie permet aux internes de se former sur les techniques manuelles puis le reste du semestre est consacré à la validation bactériologique. Les internes effectuent également un mois dans le service de virologie, passe quelques jours en sérologie, biologie moléculaire et au laboratoire P3 dédié aux prélèvements suspectés de tuberculose. Tout au long du semestre, l’interne assiste à des “café bactério” qui sont des topos et rappels sur les pathogènes et leurs entités cliniques. Ils ont lieu sur site. Le DES de bactériologie-virologie est composé de deux évaluations orales : la première, “l’audit junior”, en cours de semestre, plutôt orienté technique. La seconde évaluation, “l’audit sénior”, a lieu en fin de semestre et porte sur les connaissances biologiques en bactériologie (interprétation d’antibiogrammes, cas cliniques…) et virologie.

Semestre de parasitologie - immunologie

L’interne choisit entre un semestre en parasitologie et immunologie en fonction de son classement. Il est également possible de combiner les 2 en binôme avec un autre interne (3 mois en parasito et 3 mois en immuno) ou de faire un stage dit « libre » dans la limite des places disponibles (PMA, génétique, …).

Le semestre de parasitologie se déroule au CBN. L’interne participe à la routine des trois secteurs :

  • la sérologie : de la toxoplasmose, des glucanes, antigène aspergillaire et Ac anti-aspergillaire
  • la mycologie : identification des levures et des champignons filamenteux
  • la biologie moléculaire : interprétation des PCR Pneumocystis jirovecii et toxoplasmose.

La biomol et la recherche de parasites dans les selles peuvent être approfondies selon la curiosité de l’interne.

Le semestre d’immunologie se déroule au CBS. L’interne passe obligatoirement 3 mois en immunochimie où il participe à l’activité de routine : interprétation des électrophorèses des protéines sériques sur Phoresis (à Lyon, elles ne sont pas faites en biochimie !), lecture des plaques d’immunofixation pour le typage des pics monoclonaux